Sau mỗi đợt mưa lũ, nước từ thượng nguồn đổ về kéo theo một lượng lớn rác thải hỗn hợp. Toàn bộ khối lượng lớn này bị dồn ứ ở lòng hồ thủy điện. Do không được dọn dẹp kịp thời dẫn đến thối rữa, gây ô nhiễm môi trường, ảnh hưởng nghiêm trọng đến cuộc sống của người dân sinh sống ở lân cận. Việc phối hợp với các cơ quan chức năng để xử lý rác thải đang là việc làm cấp thiết đối với các nhà máy thủy điện hiện nay.