Đấu thầu qua mạng được coi là phương thức đấu thầu hiệu quả, giúp tiết kiệm chi phí, thời gian, minh bạch, phòng chống tham nhũng, tiêu cực. Tuy nhiên, hoạt động này hiện còn nhiều hạn chế và bất cập. Tình trạng sau khi trúng thầu, các doanh nghiệp không đáp ứng được năng lực thực tế dẫn đến phải hủy thầu diễn ra khá nhiều. Điều này không những làm cho dự án bị chậm tiến độ mà còn gây thất thoát, lãng phí nguồn lực của nhà nước.