Với 82 km bờ biển, Nghệ An là tỉnh có nhiều tiềm năng để phát triển nuôi trồng thủy sản mặn lợ. Tuy nhiên, hiện các vùng nuôi mặn lợ đã xuất hiện nhiều bất cập, trong đó hạ tầng vùng nuôi không đồng bộ đã gây ô nhiễm môi trường và dịch bệnh xuất hiện trên vật nuôi.