Trước những dự đoán về sức mạnh của siêu bão Nanmadol, Cơ quan Khí tượng Nhật đã phát cảnh báo bão đặc biệt cho tỉnh Kagoshima, cực nam đảo Kyushu, đồng thời khuyến cáo hai triệu người dân trong khu vực tìm nơi trú ẩn.
Một trận sóng thần cao 3m có thể ập vào một số hòn đảo nằm ở khu vực Tây Nam của Nhật Bản, trong đó có đảo Amami, và một trận sóng thần cao 1,2m đã được quan sát thấy ở Amami ngay trước đêm 15/1.
